Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC149Q6ZUS6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms