Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPOCD1Q6ZMY3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms