Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD40Q6AI12 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms