Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD1Q5SYB0 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms