Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms