Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KLHL12Q53G59 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms