Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AC006435.3-201ENST00000611041 203 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DSTYK-203ENST00000615388 1042 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC242842.1-201ENST00000617712 447 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 MIR6750-201ENST00000617817 75 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL513478.3-201ENST00000641038 1095 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC6-203ENST00000518642 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 IL36A-201ENST00000259211 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 GPHA2-201ENST00000279168 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SPATA32-201ENST00000331780 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP170-201ENST00000362550 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 MBD3L2-201ENST00000381393 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SNORA9B-201ENST00000384170 133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 PPM1N-204ENST00000401593 548 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD61-201ENST00000409061 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP20-1Q3LI63 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms