Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHD9Q3L8U1 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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