Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC57Q2TAC2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms