Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms