Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSPP1Q1MSJ5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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