Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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