Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EXT1Q16394 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms