Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F4Q16254 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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