Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ITSN1Q15811 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITSN1Q15811 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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