Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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