Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms