Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RAB39AQ14964 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms