Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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