Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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COL4A6Q14031 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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COL4A6Q14031 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL4A6Q14031 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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