Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGRF1Q13972 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms