Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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