Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TSTA3Q13630 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms