Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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IRF5Q13568 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF5Q13568 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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