Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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AP3B2Q13367 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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AP3B2Q13367 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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AP3B2Q13367 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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AP3B2Q13367 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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AP3B2Q13367 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
AP3B2Q13367 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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