Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SRSF6Q13247 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SRSF6Q13247 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SRSF6Q13247 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SRSF6Q13247 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SRSF6Q13247 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SRSF6Q13247 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF6Q13247 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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