Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BNIP1Q12981 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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