Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMAN2Q12907 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms