Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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TWF1Q12792 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TWF1Q12792 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TWF1Q12792 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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