Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FAM27E3Q08E93 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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