Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TFF3Q07654 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TFF3Q07654 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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TFF3Q07654 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TFF3Q07654 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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TFF3Q07654 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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TFF3Q07654 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TFF3Q07654 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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