Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FRG2FP-202ENST00000419104 559 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TCEA1-206ENST00000520534 635 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 HTR3B-201ENST00000260191 2011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms