Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
E2F1Q01094 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms