Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AP1S1P61966 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms