Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GFRA1P56159 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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