Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NCKAP1LP55160 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms