Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPAP53621 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms