Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIA4P48058 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIA4P48058 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms