Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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