Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACADSBP45954 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms