Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms