Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMPOP42166 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMPOP42166 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMPOP42166 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMPOP42166 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms