Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GGCXP38435 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGCXP38435 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGCXP38435 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGCXP38435 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGCXP38435 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GGCXP38435 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GGCXP38435 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GGCXP38435 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms