Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms