Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTSSP25774 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTSSP25774 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms