Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GCSHP23434 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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GCSHP23434 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GCSHP23434 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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