Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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CTLA4P16410 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CTLA4P16410 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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