Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FGAP02671 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FGAP02671 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FGAP02671 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms