Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBC1P01850 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBC1P01850 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBC1P01850 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms