Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSL3O95573 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ACSL3O95573 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSL3O95573 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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ACSL3O95573 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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